LAMMPS

LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款开源的分子动力学模拟软件，由美国桑迪亚国家实验室（Sandia National Laboratories）开发。软件名称直译为大规模原子/分子大规模并行模拟器，准确概括了其核心特点。

LAMMPS的开发始于1990年代中期，最初是在美国能源部资助下，由桑迪亚实验室与Cray Research、Bristol-Myers Squibb、杜邦公司以及劳伦斯利弗莫尔国家实验室共同合作的CRADA项目。主要作者是Steve Plimpton，同时也有来自全球多个研究机构的贡献者参与开发。

作为一款经典分子动力学代码，LAMMPS的核心功能包括：

粒子与模型类型：支持原子、粗粒化粒子、联合原子聚合物、全原子聚合物、有机分子、蛋白质、DNA、金属材料、颗粒材料以及介观模型等多种粒子类型。

相互作用势函数：内置丰富的势函数库，包括Lennard-Jones势、Buckingham势、Morse势、EAM（嵌入原子法）势、MEAM（改进嵌入原子法）势、ReaxFF反应力场等，可描述从简单液体到复杂化学反应的各种体系。

系综与边界条件：支持NVE、NVT、NPT等多种统计系综，以及周期性、固定、收缩等多种边界条件，可模拟各种热力学环境。

并行计算能力：采用空间分解（domain decomposition）和消息传递（MPI）技术，支持千万至百亿级粒子的大规模模拟。在异构超算平台（如天河系列、Frontier）上可实现近线性加速比。

输入输出：完全基于文本的输入脚本控制，支持从文件读取原子坐标、在晶格上创建原子、删除几何或逻辑原子组等操作。输出包括轨迹文件、热力学数据、结构分析结果等。

LAMMPS采用C++编写，以GPLv2许可证开源发布。用户可免费获取源代码，并根据需要自行修改。软件主要开发平台是Linux，同时也支持macOS和Windows系统。